六朝时，与青溪相对应的河道是运渎，台城（皇宫）分别以青溪和运渎构成了东、西两翼的水路体系。
孙权开凿运渎稍早于青溪。据《建康实录》记载，东吴赤乌三年（240）“冬，使左台侍御史郗俭监凿城西，南自秦淮，北抵仓城，名运渎。”建康宫城即吴苑城，城內有苑仓，故又名仓城。孙权此项工程，除了方便仓所的粮食运输，也是在都城西侧构筑起一道水上军事防线。
学者们探寻出古运渎河道的具体方位走向：其北端在北极阁山脚下，从进香河（今已填河为路）向西南延伸，经新街口，沿丰富路、鼎新路至红土桥，穿过升州路与秦淮河西段相接。
城南建邺路上的东吴历史柱文。沿建邺路向西，从内桥出发，经过鸽子桥、笪桥和鼎新桥，桥下就是今天残留的运渎河道，实际为古运渎的分支。《同治上江两县志》：“运渎水在城西北隅，自笪桥西流……至铁窗棂出城；又自东流，至内桥与青溪合。”这段记载与今天的河道相吻合。
《建康实录》提到运渎有六座桥，具体介绍有五座。最北端的是甓子桥，又名孝义桥，大致位于今进香河路南端，与青溪的募士桥相对。两桥的连线在今珠江路一线，也是六朝“城北堑”的大致位置，五代时在此修筑的杨吴城濠（北门桥至竺桥）一直保留到现在。
甓子桥以南是杨烈桥，其位置在新街口偏北一带，与青溪的菰首桥相对应。《宋书·王僧达传》：“（僧达）为太子舍人。坐属疾而于杨烈桥观斗鸭，为有司所纠，原不问。”王僧达是王氏门阀之后，宋文帝时任太子舍人，曾借病假跑到杨烈桥上去看斗鸭，结果被相关部门发现，因而遭到弹劾。幸亏宋文帝爱惜其文采，才未追究。杨烈桥因此留下这段趣事。
杨烈桥以南是西州桥，因处西州城东南角而得名。西州城是东晋永嘉年间设立的扬州治所。会稽王司马道子为扬州刺史时，以东府城为新治所；旧城与之相对，故号西州。西州城的兴建晚于运渎，西州桥是从州城跨越运渎通往都城的途径，大致在今笪桥附近。桥南还有高晔桥，是建康西尉的所在。
运渎在上、下浮桥之间汇入秦淮河，那里原本就是重要的物资集散地，宫城所需从秦淮河运达建康，也是在那里离岸。所以，在运渎开通以前就曾有渡口，因附近的禅灵寺而得名“禅灵渚渡”。该渡口位于新桥以北，是运渎与秦淮河的交汇处。新桥原名万岁桥，运渎通行后，人们不用再建造浮航，至隋、唐时修建此桥取代渡口。禅灵渚渡归入运渎流域，逐渐消逝在人们的视野中。
运渎入淮位置对应图，相关位置均为大致推断所在。
