1910年的进香河（选自杉江房造《金陵胜观》），彼时河道犹存。
东吴时期，运渎北延之河段正位于六朝都城的西北角，是建康城西垣的护城河，同时也承担着台城苑仓通往都城之外的交通运输之功能。从运渎开通以后，此段河道历经三百年，一直是建康城北极为重要的通航水道。
隋、唐以降，金陵都城“平荡耕垦”，运渎日渐淤塞，沦为荒渠。南唐先主徐知诰重建金陵城，并兴修杨吴城濠。运渎北段被隔于玄武门（今北门桥）以外，成为鸡笼山南麓之水流入城濠的一支沟渠。
明初，朱元璋扩建金陵城。运渎被完全围入城郭当中。《明史·志第二十六》：“（洪武）六年，建历代帝王庙于钦天山之阳。……太祖既以功臣配享太庙，又命别立庙于鸡笼山，论次功臣二十有一人。……”钦天山即鸡笼山。朱元璋在南麓建功臣及历代帝王庙；同时挖掘加宽运渎北段河道，使其与杨吴城濠相通。从此，官民皆可乘舟赴鸡鸣寺进香拜谒，“进香河”之名由此而来。
1916年《江宁县乡土志·水四》：“城内支河，合于淮水者，曰青溪、曰杨吴城濠、曰珍珠河、曰进香河、曰运渎。”进香河与珍珠河、杨吴城濠形成南京城内的一个完整水系，北面从珍珠河武庙闸直通玄武湖，南面由杨吴城濠与秦淮河相连。清《同治上江两县志》：“（进香）河上有桥，亦曰进香，益折而南，曰西仓桥、曰北石桥、曰红板桥、曰严家桥、曰莲花桥。自西仓桥至此，其数五，故又曰莲花第五桥矣。”可知，当时进香河上共有六座桥。
从古金陵桥道复原图上，可以看出进香河与杨吴城濠、珍珠河及玄武湖形成的水系，以及各桥梁之方位。
明朝后期，进香河一度淤塞，后重新疏浚。清末因城中修建京市铁路，切断了进香河来自玄武湖的地表水源，仅以地下涵洞相通。此后，进香河因年久失修逐渐沦为一条污水沟渠。
1958年，出于城市建设的需要，市政府改建进香河为道路。河道上覆盖水泥预制板，成为暗河；板上填土种植各种灌木花卉，形成美丽的绿岛；两岸辟为水泥马路，路边的人行道种植高大的水杉树，命名为“进香河路”。1992年，经进一步拓宽，进香河路更加宽阔畅通，成为市区干道。
今天的进香河路，北起北京东路，南至珠江路，全长九百多米。
